El splicing consiste en la eliminación precisa de los intrones (secuencia no codificante) del ARN mensajero precursor, y en la unión secuencial de los exones (las regiones de un gen que codifican proteína) para dar lugar al ARN mensajero maduro. Una alta proporción de las mutaciones causantes de enfermedades genéticas está asociada a anomalías en el splicing de los genes responsables.
Los investigadores han desarrollado una herramienta, el vector de splicing pSAD (siglas en inglés de Splicing and disease), para la creación de minigenes híbridos (una versión simplificada y artificial de un gen) de casi todos los exones de BRCA1 y BRCA2, los dos principales genes de predisposición al cáncer de mama. El trabajo permitirá estudiar el efecto de cualquier mutación sobre el splicing sin necesidad de una muestra de ARN del paciente.
El equipo de científicos ha mostrado que más de un tercio de las mutaciones patogénicas afectan al procesamiento del pre ARN mensajero. “La identificación de alteraciones de los patrones de splicing en BRCA1 y BRCA2 aportará una información esencial para clarificar el espectro de susceptibilidad genética a cáncer de mama y ovario”, señala Eladio Velasco, investigador del CSIC en el IBGM.
Según el investigador del IBGM, en los rastreos de mutaciones de BRCA1 y BRCA2 dentro de los programas de prevención del cáncer hereditario, hasta un 15 por ciento de las pacientes presentan variantes de ADN de significado clínico desconocido, es decir, no saben si son patogénicas o neutras, y su clasificación es tremendamente complicada. “Nosotros ofrecemos la posibilidad de clasificarlas desde el punto de vista del splicing. La clasificación de una variante de ADN como mutación patogénica de splicing permite incrementar las familias que se benefician de los protocolos de prevención”, explica.
El equipo dirigido por Velasco ha mostrado que más de un tercio de las mutaciones patogénicas afectan al procesamiento del pre-ARN mensajero. “La identificación de alteraciones de los patrones de splicing en BRCA1 y BRCA2 y otros genes de predisposición aportará una información esencial para clarificar el espectro de susceptibilidad genética al cáncer de mama”, señala el investigador del IBGM.
El pSAD ha sido utilizado en la construcción de un minigen de BRCA2, en colaboración con el Hospital Clínico San Carlos de Madrid. El IBGM de Valladolid pondrá próximamente en marcha un servicio basado en éstos minigenes en colaboración con la empresa AC-Gen Reading Life.
Transferencia de resultados
El desarrollo de la patente se ha enmarcado en la tesis doctoral del investigador Alberto Acedo, quien es además uno de los promotores de la empresa de base tecnológica AC-Gen Reading Life, ubicada en el Parque Científico Universidad de Valladolid (PCUVa). La empresa, dedicada a la aplicación de la secuenciación masiva al estudio de genes inmersos en enfermedades hereditarias, con el fin último de ayudar a la prevención y diagnóstico de estas enfermedades, podrá completar sus servicios con este nuevo desarrollo.
“Algunos autores estiman que un 60 por ciento de las variantes de ADN que se detectan en los pacientes podrían afectar al proceso de splicing, y muchas de ellas están relacionadas con una patogenicidad importante. Cuando nosotros hacemos un diagnóstico el resultado puede ser negativo, positivo o incierto, y en esos resultados inciertos es donde la herramienta que hemos desarrollado va a ser fundamental. Nuestra empresa se dedica a la secuenciación masiva y detectamos un gran número de variantes de significado incierto, de modo que la herramienta nos permitirá completar estos estudios”, detalla a DiCYT Alberto Acedo, quien ha defendido recientemente su tesis doctoral.
El objetivo ahora es que la empresa obtenga la licencia de la patente y pueda ofrecer el servicio, denominado Evaluación de variantes de ADN de efecto clínico desconocido. Acedo se muestra confiado en obtener la licencia antes de final de año y poner en marcha el servicio inmediatamente, teniendo en cuenta que la técnica, en colaboración con el CSIC, “ya ha sido puesta a punto”.
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